Достъпът до phpMyAdmin за управление на баззи данни се осъществява от бутона Админ срещу всяка база данни в секцията MySQL 4 или MySQL 5 в Административният панел.

phpMyAdmin се зарежда в отделен (нов) прозорец, като за вход трябва да използвате потребителско име на потребител, който има права върху дадената база, и неговата парола.